После нападения «Амбреллы» на корабль «Аркадия», Элис оказывается в плену у корпорации. Придя в себя, она обнаруживает себя в незнакомом доме. Рядом муж Карлос и маленькая дочь Бекки, а за окнами обычный пригород. Но спокойствие быстро заканчивается. В следующую секунду она просыпается уже в камере секретного объекта, где её допрашивает Джилл Валентайн. Бывшая союзница теперь работает на врага и, похоже, не собирается её отпускать. Ситуация меняется, когда система безопасности неожиданно даёт сбой. Элис удаётся выбраться из помещения, а вскоре она встречает Аду Вонг. Выясняется, что Вескер отправил внутрь небольшую группу, которая должна вывести её наружу. Здание контролирует Красная Королева, и она не намерена позволять пленнице уйти. Соратницы проходят через несколько зон огромного подземного комплекса в поисках выхода. Перед ними возникают знакомые города – Токио, Нью-Йорк и другие места. Здесь всё выглядит настоящим, но слишком многое не сходится: улицы населены мертвецами, а друзья превращаются в противников. Постепенно героиня понимает, что попала в часть эксперимента, связанного с вирусом и её прошлым.